Factores Biológicos

• É mais fácil a infeção pelo VIH ser transmitida através de sexo anal desprotegido do que através do sexo vaginal sem proteção.
• Se o homem tiver uma IST's, este pode ser um fator que potencia o risco da infeção pelo VIH. As IST's são relativamente comuns em algumas comunidades de HSH e porque os homens não são sempre incentivados a serem testados, muitas vezes, para as IST´s, estas não são diagnosticadas e, por conseguinte, não são tratadas.

Factores comportamentais

• Certos comportamentos aumentam o risco de infeção pelo VIH para os HSH, como por exemplo, terem múltiplos parceiros sexuais ou não usarem o preservativo consistentemente.
• O álcool e as drogas são práticas muito comuns de sociabilização em muitas comunidades de HSH. As bebidas e as drogas podem tornar mais provável que as pessoas tenham relações sexuais desprotegidas e a terem um maior número de parceiros sexuais. Nos EUA, por exemplo, um estudo em Los Angeles revelou que HSH e que usam crystal meth tinham três vezes mais probabilidade de se infetarem pelo VIH do que os HSH que não usavam

Factores Socio-culturais

• Alguns governos e sociedades estão em negação sobre o facto da existência desta população. É um assunto tabu em muitas culturas. Como resultado, as ações de prevenção do VIH acabam por só falar sobre os riscos dos comportamentos homossexuais, o que lhes pode dar uma falsa impressão de que não estão em risco.
• Em países, em que o sexo entre homens é criminalizado, os HSH são excluídos dos serviços de saúde sexual e podem ter dificuldade em aceder a preservativos e lubrificantes para, deste modo, se protegerem da infeção pelo VIH.
• Uma certa proporção de relações sexuais entre HSH na maioria dos países é comercial. Tal como acontece com mulheres trabalhadoras do sexo, os trabalhadores do sexo masculino ou os transgeneros, podem achar que é difícil convencer os clientes a usar preservativo ou pode até mesmo, ser oferecido mais dinheiro para terem relações sexuais desprotegidas, aumentando o risco à infeção pelo VIH. Em alguns países existem programas de VIH destinados aos TS femininos mas pouco ou nada existe para TS masculinos.
• Em países onde os antiretrovíricos estão amplamente difundidos, um clima de otimismo sobre a eficácia do tratamento pode levar alguns HSH a correrem maiores riscos.
• A dependência de uma família por apoio emocional, económico e educacional, impede, muitas vezes, que os jovens exponham a sua verdadeira orientação sexual, o que torna difícil conseguir chegar até eles, serviços "desenhados" para HSH.
• Os HSH são mais propensos a sofrer de depressões devido ao isolamento social e à desconexão com os sistemas de saúde, o que pode tornar mais difícil lidar com aspetos do VIH, como por exemplo, a adesão terapêutica.